doc. Mgr.

Václav Brázda

Ph.D.

FCH, ÚCHPBT – docent

+420 54114 9418
brazda@fch.vut.cz

Odeslat VUT zprávu

doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.

Publikace

  • 2021

    BOHÁLOVÁ, N.; CANTARA, A.; BARTAS, M.; KAURA, P.; ŠŤASTNÝ, J.; PEČINKA, P.; FOJTA, M.; MERGNY, J.; BRÁZDA, V. Analyses of viral genomes for G-quadruplex forming sequences reveal their correlation with the type of infection. BIOCHIMIE, 2021, roč. 186, č. 1, s. 13-27. ISSN: 0300-9084.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    BOHÁLOVÁ, N.; CANTARA, A.; BARTAS, M.; KAURA, P.; ŠŤASTNÝ, J.; PEČINKA, P.; FOJTA, M.; BRÁZDA, V. Tracing dsDNA Virus–Host Coevolution through Correlation of Their G-Quadruplex-Forming Sequences. International Journal of Molecular Sciences, 2021, roč. 22, č. 7, s. 1-12. ISSN: 1422-0067.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    MONTI, P.; BRÁZDA, V.; BOHÁLOVÁ, N.; PORUBIAKOVÁ, O.; MENICHINI, P.; SPECIALE, A.; BOCCIARDI, R.; INGA, A.; FRONZA, G. Evaluating the Influence of a G-Quadruplex Prone Sequence on the Transactivation Potential by Wild-Type and/or Mutant P53 Family Proteins through a Yeast-Based Functional Assay. Genes, 2021, roč. 12, č. 2, s. 1-13. ISSN: 2073-4425.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    BRÁZDA, V.; PORUBIAKOVÁ, O.; CANTARA, A.; BOHÁLOVÁ, N.; COUFAL, J.; BARTAS, M.; FOJTA, M.; MERGNY, J. G-quadruplexes in H1N1 influenza genomes. BMC GENOMICS, 2021, roč. 22, č. 1, s. 1-11. ISSN: 1471-2164.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    PORUBIAKOVÁ, O.; CANTARA, A.; PŘEPECHALOVÁ, V.; BRÁZDA, V. Comparison between synthetic and natural G4-ligands and the effects of their binding to DNA. 2021. s. 1 (1 s.).
    Detail

  • 2020

    BARTAS, M.; BRÁZDA, V.; BOHÁLOVÁ, N.; CANTARA, A.; VOLNÁ, A.; STACHUROVÁ, T.; MALACHOVÁ, K.; BRÁZDOVÁ JAGELSKÁ, E.; PORUBIAKOVÁ, O.; CERVEN, J.; PEČINKA, P. In-depth Bioiformatic Analyses of Human SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV, and Other Nidovirales Suggest Important Roles of Noncanonical Nucleic Acid Structures in Their Lifecycles. Frontiers in Microbiology, 2020, roč. 11, č. 1, s. 1-29. ISSN: 1664-302X.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; BRÁZDA, V. The influence of non-canonical structures on the p53 isoform binding to DNA. Sborník príspevků. 2020. s. 185-192. ISBN: 978-80-214-5921-2.
    Detail

    PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; BRÁZDA, V. The influence of non-canonical structures on the p53 isoforms binding to DNA. 2020.
    Detail

    PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; BRÁZDA, V. G-quasruplex structure in proximity of p53 target sequence causes significant inhibition on transactivation potential of p53 isoforms. Sborník abstraktů. 2020. ISBN: 978-80-214-5920-0.
    Detail

    BRÁZDA, V.; LUO, Y.; BARTAS, M.; KAURA, P.; PORUBIAKOVÁ, O.; ŠŤASTNÝ, J.; PEČINKA, P.; VERGA, D.; DA CUNHA, V.; S. TAKAHASHI, T.; FORTERRE, P.; MYLLYKALLIO, H.; FOJTA, M.; MERGNY, J. G-quadruplexes in the Archaea Domain. Biomolecules, 2020, roč. 10, č. 9, s. 1-23. ISSN: 2218-273X.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    BRÁZDA, V.; KOLOMAZNÍK, J.; MERGNY, J.; ŠŤASTNÝ, J. G4Killer web application: a tool to design G-quadruplex mutations. BIOINFORMATICS, 2020, roč. 36, č. 10, s. 3246-3247. ISSN: 1367-4803.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; INGA, A.; VADOVIČOVÁ, N.; COUFAL, J.; FOJTA, M.; BRÁZDA, V. The influence of quadruplex structure in proximity to p53 target sequences on the transactivation potential of p53alpha isoforms. International Journal of Molecular Sciences, 2020, roč. 21, č. 1, s. 1-15. ISSN: 1422-0067.
    Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

    ČUTOVÁ, M.; MANTA, J.; PORUBIAKOVÁ, O.; KAURA, P.; ŠŤASTNÝ, J.; BRÁZDOVÁ JÁGELSKÁ, E.; GOSWAMI, P.; BARTAS, M.; BRÁZDA, V. Divergent distributions of inverted repeats and G-quadruplex forming sequences in Saccharomyces cerevisiae. GENOMICS, 2020, roč. 112, č. 2, s. 1897-1901. ISSN: 0888-7543.
    Detail | WWW

  • 2019

    PORUBIAKOVÁ, O.; BRÁZDA, V.; BOHÁLOVÁ, N. p53alpha protein isoforms binds preferentially to cruciform in transactivation yeast isogenic system. 2019.
    Detail

    PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; BRÁZDA, V.; INGA, A. Attenuation of p53-alpha isoform binding to DNA by inverted repeat abolishment in p53 target. 2019.
    Detail

    PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; INGA, A.; BRÁZDA, V. Attenuation of p53-alpha isoform transactivation by inverted repeat sequences in p53 target sites. FEBS Open Bio. 2019. s. 1 (1 s.). ISSN: 2211-5463.
    Detail | WWW

    BARTAS, M.; ČUTOVÁ, M.; BRÁZDA, V.; KAURA, P.; ŠŤASTNÝ, J.; KOLOMAZNÍK, J.; COUFAL, J.; GOSWAMI, P.; ČERVEŇ, J.; PEČINKA, P. The Presence and Localization of G-Quadruplex Forming Sequences in the Domain of Bacteria. MOLECULES, 2019, roč. 24, č. 9, s. 1-13. ISSN: 1420-3049.
    Detail | WWW

    BRÁZDA, V.; PORUBIAKOVÁ, O.; BOHÁLOVÁ, N.; INGA, A.; FOJTA, M. Attenuation of p53-alpha isoform transactivation by inverted repeat sequernces in p53 target sites. 2019. s. 1 (1 s.).
    Detail

    BRÁZDA, V.; KOLOMAZNÍK, J.; LÝSEK, J.; BARTAS, M.; FOJTA, M.; ŠŤASTNÝ, J.; MERGNY, J.-L. G4Hunter web application: a web server for G-quadruplex prediction. BIOINFORMATICS, 2019, roč. 35, č. 18, s. 3493-3495. ISSN: 1367-4803.
    Detail | WWW

    BRÁZDA, V.; JAGELSKÁ, E. B.; KOLOMAZNÍK, J.; LÝSEK, J.; KAURA, P.; BARTAS, M.; COUFAL, J.; ŠŤASTNÝ, J. DNA analyser, a new powerful tool to identify and analyse local DNA structures in genomes. FEBS Open Bio. 2019. s. 149-149. ISSN: 2211-5463.
    Detail | WWW

  • 2018

    BRÁZDA, V.; TOMANOVÁ, B.; COUFAL, J. Yeast isogenic system as a tool for study protein interaction with DNA structures. FEBS Open Bio. FEBS, 2018. s. 191-191. ISSN: 2211-5463.
    Detail

    KONEČNÁ, J.; CHVALKOVSKÁ, E.; KNÁPKOVÁ, M.; ŠPANOVÁ, A.; RITTICH, B.; BRÁZDA, V. High resolution melting analysis for identification of strains beloging to the Lactobacillus casei group. In Študentská vedecká konferencia PriF UK 2018 Zborník recenzovaných príspevkov. 2018. s. 302-307. ISBN: 978-80-223-4517-0.
    Detail

    BRÁZDA, V.; TOMANOVÁ, B.; COUFAL, J., Něměček M. YEAST ISOGENIC SYSTEM AS A TOOL FOR STUDY P53 PROTEIN INTERACTION WITH DNA. 34th Annual Conference on Yeasts, Book of abstracts. Bratislava: SAV, 2018. s. 27-27. ISSN: 1336-4839.
    Detail

*) Citace publikací se generují jednou za 24 hodin.