Publication detail

Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů

ŠKUTKOVÁ, H. PROVAZNÍK, I. KIZEK, R.

Original Title

Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů

English Title

Phylogenetic tree structure of metallothionen sub-family

Type

conference paper

Language

Czech

Original Abstract

Metallothioneiny (MT) jsou malé na cysteiny bohaté proteiny, které v organismu zajišťují transport kovů. Přestože byli MT poprvé popsány již roku 1957 všechny jejich možnosti a vlivy na organismus nejsou zatím dostatečně objasněny. Pro zjištění podobnosti molekulární struktury bílkovin jsme využili fylogenetickou analýzu, která zjišťuje evoluční příbuznost organismů. Protože celá veřejná databáze obsahuje přes 1000 záznamů z obrovské rodiny MT zařazených jak do eukaryotických tak prokaryotických organismů, zkonstruovali jsme několik fylogenetických stromů pro určité vybrané taxonomické skupiny MT: bakterie, lidé a rostliny.

English abstract

Metallothioneins (MTs) are small cysteine-rich proteins that are involved in many diverse biological processes. These multifunction proteins constitute a superfamily. They are found not only in eukaryotes, but also in prokaryotic micro organisms. Although they keep analogical function, their primary structures are often diverse. Phylogenetic analysis reveals similarities and dissimilarities in sequence structures among various subfamilies of MTs.

Keywords

fylogenetický strom, neigbour-joining, BIONJ, Jukes-Cantor, metallothionein

Key words in English

Metallothionein, phylogenetic, sequence motif, sequence logo, BIONJ

Authors

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R.

RIV year

2010

Released

20. 4. 2010

Publisher

Muni Press

Location

Brno

ISBN

978-80-210-5164-5

Book

XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů

Edition number

14

Pages from

77

Pages to

78

Pages count

2

BibTex

@inproceedings{BUT29966,
  author="Helena {Vítková} and Valentine {Provazník} and René {Kizek}",
  title="Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů",
  booktitle="XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů",
  year="2010",
  number="14",
  pages="77--78",
  publisher="Muni Press",
  address="Brno",
  isbn="978-80-210-5164-5"
}