Detail publikace

Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin

JUGAS, R.

Originální název

Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin

Český název

Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin

Anglický název

Digital Signal Processing for Genome Classification of Plants

Typ

článek ve sborníku

Jazyk

cs

Originální abstrakt

Numerické reprezentace DNA sekvence prošly v posledních několika letech výrazným rozvojem. Existuje větší množství technik, které produkují signály s různými vlastnostmi. V této práci prezentujeme konstrukci dendrogramů pro tři různé signálové reprezentace a srovnání těchto dendrogramů s metodou založenou na vícenásobném znakovém zarovnání. Klasifikace signal je provedena jako shluková analýzay založená na Euklidovské metrice vzdáleností všech dvojic signal zarovnaných pomocí dynamického borcení časové osy.

Český abstrakt

Numerické reprezentace DNA sekvence prošly v posledních několika letech výrazným rozvojem. Existuje větší množství technik, které produkují signály s různými vlastnostmi. V této práci prezentujeme konstrukci dendrogramů pro tři různé signálové reprezentace a srovnání těchto dendrogramů s metodou založenou na vícenásobném znakovém zarovnání. Klasifikace signal je provedena jako shluková analýzay založená na Euklidovské metrice vzdáleností všech dvojic signal zarovnaných pomocí dynamického borcení časové osy.

Anglický abstrakt

Numerical representations of DNA sequence underwent a significant development during last few years. Nevertheless, there are several techniques producing signals with various features. In this work, we present dendrogram construction for three different signal representations and its comparison with standard method based on multiple alignment of character sequences. Signal classification is performed as a cluster analysis using Euclidian metrics measuring pairwise distance between all pairs of signals aligned using dynamic time warping.

Klíčová slova

klasifikace, DNA signál, dtw

Rok RIV

2014

Vydáno

24.04.2014

Nakladatel

LITERA

Místo

Brno

ISBN

978-80-214-4922-0

Kniha

Proceedings of the 20th conference Student EEICT 2014

Číslo edice

1.

Strany od

132

Strany do

134

Strany počet

3

BibTex


@inproceedings{BUT107381,
  author="Robin {Jugas}",
  title="Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin",
  annote="Numerické reprezentace DNA sekvence prošly v posledních několika letech výrazným rozvojem. Existuje větší množství technik, které produkují signály s různými vlastnostmi. V této práci prezentujeme konstrukci dendrogramů pro tři různé signálové reprezentace a srovnání těchto dendrogramů s metodou založenou na vícenásobném znakovém zarovnání. Klasifikace signal je provedena jako shluková analýzay založená na Euklidovské metrice vzdáleností všech dvojic signal zarovnaných pomocí dynamického borcení časové osy.",
  address="LITERA",
  booktitle="Proceedings of the 20th conference Student EEICT 2014",
  chapter="107381",
  howpublished="print",
  institution="LITERA",
  year="2014",
  month="april",
  pages="132--134",
  publisher="LITERA",
  type="conference paper"
}