Detail publikace

Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction

SEDLÁŘ, K. ŠKUTKOVÁ, H.

Originální název

Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction

Anglický název

Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction

Typ

článek ve sborníku ve WoS nebo Scopus

Jazyk

čeština

Originální abstrakt

V posledních desetiletích zaznamenala fylogenetická rekonstrukce obrovský rozvoj spojený s lepší dostupností molekulárních dat. Do budoucna lze předpokládat její ještě masivnější využití způsobené stále rychlejším sekvenováním genomických dat. Současně s tím vyvstává otázka, jakým způsobem bude hodnocena kvalita fylogenetických stromů. Účinným nástrojem pro tuto operaci se jeví bootstrapping. I v rámci této techniky však existují odlišné přístupy a neexistuje jednotný názor na interpretaci hodnot, které nám poskytuje.

Anglický abstrakt

In recent decades, phylogenetic reconstruction went through huge development coupled with better availability of molecular data. We can expect its wider use in the future due to increasing speed of sequencing of genomic data. At the same time the question how to evaluate the quality of phylogenetic trees raises. Bootstrap appears to be an effective tool for this operation. However there are different approaches in the bootstrap technique and there is no agreement on the interpretation of values it provides.

Klíčová slova

fylogenetika, bootstrapping, konsensuální strom, podpora

Klíčová slova v angličtině

phylogenetics, bootstrap, consensus tree, support

Autoři

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.

Rok RIV

2011

Vydáno

28. 4. 2011

Nakladatel

VUT v Brně

Místo

Brno

ISBN

978-80-214-4271-9

Kniha

Sborník soutěže Student EEICT 2011

Strany od

130

Strany do

132

Strany počet

3

BibTex

@inproceedings{BUT36138,
  author="Karel {Sedlář} and Helena {Vítková}",
  title="Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction",
  booktitle="Sborník soutěže Student EEICT 2011",
  year="2011",
  pages="130--132",
  publisher="VUT v Brně",
  address="Brno",
  isbn="978-80-214-4271-9"
}