Detail publikace

Vliv rozptylu výpočtu hodnot na rekonstrukci fylogeneze proteinů

ŠKUTKOVÁ, H. PROVAZNÍK, I. KIZEK, R.

Originální název

Influence of sample variance on the phylogenetic reconstruction of protein sequences

Český název

Vliv rozptylu výpočtu hodnot na rekonstrukci fylogeneze proteinů

Anglický název

Influence of sample variance on the phylogenetic reconstruction of protein sequences

Typ

článek ve sborníku

Jazyk

en

Originální abstrakt

This study deals with the influence of sample variance of evolutionary distance estimation on phylogeny reconstruction of protein sequences. We modified the currently used methods by more precise calculation of the sample variance depending on the type of sequences and the used evolutionary model to eliminate this influence.

Český abstrakt

Tato studie se zabývá vlivem výběrového rozptylu odhadu evoluční vzdálenosti na rekonstrukci fylogeneze proteinových sekvencí. Modifikovali jsme současné využívané metody přesnějším výpočetem výběrový rozptylu v závislosti na typu použité sekvence a využívaného evolučního modelu pro odstranění vlivu rozptylu v průběhu rekonstrukce.

Anglický abstrakt

This study deals with the influence of sample variance of evolutionary distance estimation on phylogeny reconstruction of protein sequences. We modified the currently used methods by more precise calculation of the sample variance depending on the type of sequences and the used evolutionary model to eliminate this influence.

Klíčová slova

fylogenetický strom; rozptyl výpočtu; evoluční vzdálenost; vzájemná vzdálenost; Jukes-Cantor; Neighbor-Joining; BIONJ; sekvence proteinů

Rok RIV

2011

Vydáno

26.10.2011

ISBN

978-1-4503-0913-4

Kniha

ACM digital library: Proceedings of 4th International Symposium on Applied Sciences in Biomedical and Communication Technologies

Strany od

1

Strany do

5

Strany počet

5

BibTex


@inproceedings{BUT73998,
  author="Helena {Škutková} and Ivo {Provazník} and René {Kizek}",
  title="Influence of sample variance on the phylogenetic reconstruction of protein sequences",
  annote="This study deals with the influence of sample variance of evolutionary distance estimation on phylogeny reconstruction of protein sequences. We modified the currently used methods by more precise calculation of the sample variance depending on the type of sequences and the used evolutionary model to eliminate this influence.",
  booktitle="ACM digital library: Proceedings of 4th International Symposium on Applied Sciences in Biomedical and Communication Technologies",
  chapter="73998",
  howpublished="electronic, physical medium",
  year="2011",
  month="october",
  pages="1--5",
  type="conference paper"
}