Detail publikace

Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování

ŠKUTKOVÁ, H. VÍTEK, M. PROVAZNÍK, I.

Originální název

Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování

Český název

Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování

Typ

článek ve sborníku ve WoS nebo Scopus

Jazyk

cs

Originální abstrakt

Srovnání celých genomů organismů ve formě genomických číslicových signálů přináší nové možnosti analýzy DNA, které v klasickém „symbolovém“ zpracování nukleových kyselin nebyly možné. Zachovává většinu klasických technik pro analýzu genomických dat, jako jsou: zarovnání sekvencí, fylogenetická analýza, mapování genu, vyhledání strukturálních podobností apod. Ty však mnohonásobně urychluje a snižuje výpočetní náročnost pro velké objemy dat. Tím zpřístupňuje velké srovnávací studie celých genomů více organismů, které dříve zabraly celým týmům i několik let. Možnosti číslicového zpracování genomických dat jsou demonstrovány na srovnávací studii nejaktuálnějších záznamů genomů člověka a šimpanze.

Český abstrakt

Srovnání celých genomů organismů ve formě genomických číslicových signálů přináší nové možnosti analýzy DNA, které v klasickém „symbolovém“ zpracování nukleových kyselin nebyly možné. Zachovává většinu klasických technik pro analýzu genomických dat, jako jsou: zarovnání sekvencí, fylogenetická analýza, mapování genu, vyhledání strukturálních podobností apod. Ty však mnohonásobně urychluje a snižuje výpočetní náročnost pro velké objemy dat. Tím zpřístupňuje velké srovnávací studie celých genomů více organismů, které dříve zabraly celým týmům i několik let. Možnosti číslicového zpracování genomických dat jsou demonstrovány na srovnávací studii nejaktuálnějších záznamů genomů člověka a šimpanze.

Klíčová slova

Homo sapiens, Pan troglodytes, číslicové zpracování genomických signálů, celogenomová DNA, komparativní genomika

Rok RIV

2013

Vydáno

03.07.2013

ISBN

978-80-8086-208-4

Kniha

Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013

Strany od

1

Strany do

5

Strany počet

5

BibTex


@inproceedings{BUT102323,
  author="Helena {Škutková} and Martin {Vítek} and Ivo {Provazník}",
  title="Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování",
  annote="Srovnání celých genomů organismů ve formě genomických číslicových signálů přináší nové možnosti analýzy DNA, které v klasickém „symbolovém“ zpracování nukleových kyselin nebyly možné. Zachovává většinu klasických technik pro analýzu genomických dat, jako jsou: zarovnání sekvencí, fylogenetická analýza, mapování genu, vyhledání strukturálních podobností apod. Ty však mnohonásobně urychluje a snižuje výpočetní náročnost pro velké objemy dat. Tím zpřístupňuje velké srovnávací studie celých genomů více organismů, které dříve zabraly celým týmům i několik let. Možnosti číslicového zpracování genomických dat jsou demonstrovány na srovnávací studii nejaktuálnějších záznamů genomů člověka a šimpanze.",
  booktitle="Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013",
  chapter="102323",
  howpublished="electronic, physical medium",
  year="2013",
  month="july",
  pages="1--5",
  type="conference paper"
}