Detail publikace

Určení příbuznosti baktérii pomocí polární reprezentace

KUBICOVÁ, V. NEDVĚD, J. PROVAZNÍK, I.

Originální název

Determination of Relationship among Bacteria Based on Polar Representation

Český název

Určení příbuznosti baktérii pomocí polární reprezentace

Anglický název

Determination of Relationship among Bacteria Based on Polar Representation

Typ

konferenční sborník (ne článek)

Jazyk

en

Originální abstrakt

We present two methods for determination of relationship among bacteria. The proposed methods use polar coordinate representation from whole bacteria genome. The first method is related to the frequency of dual nucleotides, the second method is related to the frequency of trinucleotides. Reliability of methods was verified on dataset that consists of 21 bacteria.

Český abstrakt

Představujeme dvě metody pro určení příbuznosti bakterií. Navržené metody využívají polární reprezentaci z celého genomu bakterie. První metoda se vztahuje k frekvenci duálních nukleotidů, druhá metoda se vztahuje k frekvenci trinukleotidů. Spolehlivost metod byla ověřena na souboru dat, který se skládá z 21 bakterií.

Anglický abstrakt

We present two methods for determination of relationship among bacteria. The proposed methods use polar coordinate representation from whole bacteria genome. The first method is related to the frequency of dual nucleotides, the second method is related to the frequency of trinucleotides. Reliability of methods was verified on dataset that consists of 21 bacteria.

Klíčová slova

příbuznost, baktérie, polárna reprezentácia DNA

Vydáno

29.05.2013

Nakladatel

LITERA BRNO

Místo

Brno

ISBN

978-80-7375-757-1

Kniha

XIII pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků

Edice

1.

Číslo edice

1.

Strany od

123

Strany do

124

Strany počet

2

BibTex


@proceedings{BUT100291,
  author="Vladimíra {Kubicová} and Jiří {Nedvěd} and Ivo {Provazník}",
  title="Determination of Relationship among Bacteria Based on Polar Representation",
  annote="We present two methods for determination of relationship among bacteria. The proposed methods use polar coordinate representation from whole bacteria genome. The first method is related to the frequency of dual nucleotides, the second method is related to the frequency of trinucleotides. Reliability of methods was verified on dataset that consists of 21 bacteria.",
  address="LITERA BRNO",
  booktitle="XIII pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků",
  chapter="100291",
  edition="1.",
  howpublished="print",
  institution="LITERA BRNO",
  year="2013",
  month="may",
  pages="123--124",
  publisher="LITERA BRNO",
  type="conference proceedings"
}