Detail projektu

Moderní přístupy v analýze signálů, systémů a dat v biomedicínských aplikacích

Období řešení: 01.01.2020 — 31.12.2022

O projektu

Projekt je zaměřen obecně na aplikace inženýrských principů do oblastí biomedicíny, biologie a bioinformatiky. V těchto oblastech se zaměřuje na konkrétní témata, která jsou dlouhodobě předmětem výzkumu na UBMI. Jde zejména o zpracování a analýzu biosignálů (EKG, EMG, polysomnografie), zpracování a analýzu obrazů z různých zobrazovacích modalit (především optické zobrazování, MRI a CT), výzkum viability buněk pomocí mikroskopických metod a aplikace pokročilých matematických metod pro zpracování a analýzu genomických signálů.

Označení

FEKT-S-20-6195

Originální jazyk

čeština

Řešitelé

Kolář Radim, doc. Ing., Ph.D.
- hlavní řešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Bartoň Vojtěch, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Čejková Darina, Mgr. Bc., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Čmiel Vratislav, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Enikeev Amir, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Harabiš Vratislav, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Hejč Jakub, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Hesko Branislav, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Hracho Michal, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Chmelík Jiří, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Chmelíková Larisa
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Jakubíček Roman, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Janoušek Oto, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Jugas Robin, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Jurečková Kateřina, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Kašpar Jakub, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Kolářová Jana, doc. Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Kozumplík Jiří, doc. Ing., CSc.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Králík Martin, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Maršánová Lucie, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Mézl Martin, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Musilová Jana, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Němcová Andrea, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Novotná Petra, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Nykrýnová Markéta, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Odstrčilík Jan, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Paštěka Richard, Ing., MSc
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Provazník Ivo, prof. Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Ronzhina Marina, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Roy Sudeep, Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Sedlář Karel, Mgr. Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Smíšek Radovan, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Smital Lukáš, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Svozilová Veronika, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Škutková Helena, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Tyagi Atul, M.Sc., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Valterová Eva, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Vičar Tomáš, Ing.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)
Vítek Martin, Ing., Ph.D.
- spoluřešitel (01.01.2020 - 31.12.2022)

Útvary

Ústav biomedicínského inženýrství
- interní (01.01.2020 - 31.12.2022)
Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
- příjemce (01.01.2020 - 31.12.2022)

Zdroje financování

Vysoké učení technické v Brně - Vnitřní projekty VUT
- plně financující (2020-01-01 - 2021-12-31)

Výsledky

NOVOTNÁ, P.; VIČAR, T.; RONZHINA, M.; HEJČ, J.; KOLÁŘOVÁ, J. Deep-Learning Premature Contraction Localization in 12-lead ECGfrom Whole Signal Annotations. In Computing in Cardiology 2020. Computers in Cardiology. 47. Rimini, Italy: Computing in Cardiology 2020, 2020. p. 1-4. ISSN: 0276-6574.
Detail

NYKRÝNOVÁ, M.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Detection of Highly Variable Genome Fragments in Unmapped Reads of Escherichia coli Genomes. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science. 2020. p. 569-578. ISBN: 978-3-030-45384-8. ISSN: 0302-9743.
Detail

NĚMCOVÁ, A.; JORDÁNOVÁ, I.; VAŘEČKA, M.; SMÍŠEK, R.; MARŠÁNOVÁ, L.; SMITAL, L.; VÍTEK, M. Monitoring of heart rate, blood oxygen saturation, and blood pressure using a smartphone. Biomedical Signal Processing and Control, 2020, vol. 59, no. May 2020, p. 1-10. ISSN: 1746-8108.
Detail

BARTOŇ, V.; NYKRÝNOVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Watershed Segmentation for Peak Picking in Mass Spectrometry Data. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science. 2020. p. 494-502. ISBN: 978-3-030-45384-8. ISSN: 0302-9743.
Detail

PAL, A.; ROY, S.; KUMAR, A.; MAHMOOD, S.; KHODAPANAH, N.; THOMAS, S.; AGATEMOR, C.; GHOSAL, K. Physicochemical Characterization, Molecular Docking, and In Vitro Dissolution of Glimepiride−Captisol Inclusion Complexes. ACS OMEGA, 2020, vol. 5, no. 32, p. 19968-19977. ISSN: 2470-1343.
Detail

SCHWARZEROVÁ, J. Reproducible analytical pipeline for using raw RNA-Seq data from non-model organisms. Proceedings of the 26th Conference STUDENT EEICT 2020. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2020. p. 225-228. ISBN: 978-80-214-5867-3.
Detail

SMITAL, L.; HAIDER, C.; VÍTEK, M.; LEINVEBER, P.; JURÁK, P.; NĚMCOVÁ, A.; SMÍŠEK, R.; MARŠÁNOVÁ, L.; PROVAZNÍK, I.; FELTON, C.; GILBERT, B.; HOLMES, D. Real-Time Quality Assessment of Long-Term ECG Signals Recorded by Wearables in Free-Living Conditions. IEEE TRANSACTIONS ON BIOMEDICAL ENGINEERING, 2020, vol. 67, no. 10, p. 2721-2734. ISSN: 1558-2531.
Detail

VIČAR, T.; HEJČ, J.; NOVOTNÁ, P.; RONZHINA, M.; JANOUŠEK, O. ECG Abnormalities Recognition Using Convolutional Networkwith Global Skip Connections and Custom Loss Function. In Computing in Cardiology 2020. Computers in Cardiology. 47. Rimini, Italy: Computing in Cardiology 2020, 2020. p. 1-4. ISSN: 0276-6574.
Detail

JAKUBÍČEK, R.; VIČAR, T.; CHMELÍK, J.: CTDeepRot; CTDeepRot. Ústav biomedicínského inženýrství Vysoké učení technické v Brně Technická 12 616 00 Brno Česká republika +web GitHub. URL: https://github.com/JakubicekRoman/CTDeepRot. (software)
Detail

NOVOTNÁ, P.: Generátor šumu; Software pro generování šumu v 1D signálech. Ústav biomedicínského inženýrství, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, VUT v Brně, Technická 12, Brno 61600. URL: https://github.com/PetraNovotna/generator_sumu. (software)
Detail