Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2018/2019

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Akreditace od: 1.6.2014Akreditace do: 31.12.2022

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Sem.Pov.Uk.Sk.Ot.
BIOBiometrické systémycs5zimníPovinnýzá,zkano
MATMatematické struktury v informaticecs5zimníPovinnýzkano
BCO_MOG1Molekulární genetika Ics3zimníPovinnýzkano
PDBPokročilé databázové systémycs5zimníPovinnýzá,zkano
TINTeoretická informatikacs5zimníPovinnýzá,zkano
STISeminář teoretické informatikycs2zimníVolitelnýano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Sem.Pov.Uk.Sk.Ot.
BIFBioinformatikacs5letníPovinnýzkano
BINBiologií inspirované počítačecs5letníPovinnýzkano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5letníPovinnýzá,zkano
PP1Projektová praxe 1cs5letníVolitelnýano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Sem.Pov.Uk.Sk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4zimníPovinnýzkano
SEPSemestrální projektcs5zimníPovinnýklano
SFCSoft Computingcs5zimníPovinnýzá,zkano
THETeorie hercs4zimníPovinnýzá,zkano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5zimníPovinnýzá,zkano
PP2Projektová praxe 2cs5zimníVolitelnýklano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Sem.Pov.Uk.Sk.Ot.
DIPDiplomová prácecs13letníPovinnýano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Sem.Pov.Uk.Sk.Ot.
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs3zimníPovinně volitelnýzá,zkano
AEUAngličtina pro Evropucs3zimníPovinně volitelnýzá,zkano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs3zimníPovinně volitelnýano
BISBezpečnost informačních systémůcs5zimníPovinně volitelnýzá,zkano
FITDějiny a filozofie technikycs3zimníPovinně volitelnýano
HSCHardware/Software Codesigncs5zimníPovinně volitelnýzá,zkano
SINInteligentní systémycs5zimníPovinně volitelnýzkano
HKOKomunikační dovednostics3zimníPovinně volitelnýano
HKAKonflikty a asertivitacs3zimníPovinně volitelnýano
PCSPokročilé číslicové systémycs5zimníPovinně volitelnýzkano
PRMPrávní minimumcs3zimníPovinně volitelnýano
HPRPrezentační dovednostics3zimníPovinně volitelnýano
HPOPsychologie osobnostics3zimníPovinně volitelnýano
RETRétorikacs3zimníPovinně volitelnýano
HVRVedení a řízení lidícs3zimníPovinně volitelnýano
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)en5zimníPovinně volitelnýzkne
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5zimníVolitelnýzá,zkano
ACHArchitektura procesorůcs5zimníVolitelnýzá,zkano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5zimníVolitelnýzá,zkano
C3PDiagnostika Cisco sítí (TSHOOT)cs5zimníVolitelnýklano
EIPEkonomie informačních produktůcs5zimníVolitelnýzkano
FAVFormální analýza a verifikacecs5zimníVolitelnýzá,zkano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5zimníVolitelnýzkano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs5zimníVolitelnýzá,zkano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5zimníVolitelnýzkano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5zimníVolitelnýzá,zkano
GALGrafové algoritmycs5zimníVolitelnýzkano
SENInteligentní senzorycs5zimníVolitelnýzá,zkano
MMOBModelování biologických systémůcs4zimníVolitelnýzá,zkne
PGRPočítačová grafikacs5zimníVolitelnýzkano
POVaPočítačové vidění (v angličtině)en5zimníVolitelnýzkano
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)en5zimníVolitelnýzkano
PKSPokročilé komunikační systémycs5zimníVolitelnýzá,zkano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs5zimníVolitelnýzkano
ROSaReal-time operační systémy (v angličtině)en5zimníVolitelnýzkano
ROBaRobotika (v angličtině)en5zimníVolitelnýzkano
SMTSeminář matematických strukturcs2zimníVolitelnýano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5zimníVolitelnýzkano
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)en5zimníVolitelnýklano
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)en5zimníVolitelnýzkano
VINVýtvarná informatikacs5zimníVolitelnýklano
ZPXZahraniční odborná praxeen5zimníVolitelnýano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Sem.Pov.Uk.Sk.Ot.
AGSAgentní a multiagentní systémycs5letníPovinně volitelnýzkano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs3letníPovinně volitelnýzá,zkano
AEUAngličtina pro Evropucs3letníPovinně volitelnýzá,zkano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5letníPovinně volitelnýzkano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5letníPovinně volitelnýzá,zkano
FITDějiny a filozofie technikycs3letníPovinně volitelnýne
FIKFilozofie a kulturacs3letníPovinně volitelnýano
KKOKódování a komprese datcs5letníPovinně volitelnýzá,zkano
HKOKomunikační dovednostics3letníPovinně volitelnýano
HKAKonflikty a asertivitacs3letníPovinně volitelnýano
KRYKryptografiecs5letníPovinně volitelnýzá,zkano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5letníPovinně volitelnýzkano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5letníPovinně volitelnýzá,zkano
POSPokročilé operační systémycs5letníPovinně volitelnýzkano
PRMPrávní minimumcs3letníPovinně volitelnýano
HPRPrezentační dovednostics3letníPovinně volitelnýano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs5letníPovinně volitelnýzkano
HPOPsychologie osobnostics3letníPovinně volitelnýano
RETRétorikacs3letníPovinně volitelnýano
SNTSimulační nástroje a technikycs5letníPovinně volitelnýzá,zkano
HVRVedení a řízení lidícs3letníPovinně volitelnýano
ZREZpracování řečových signálůcs5letníPovinně volitelnýzkano
BZABezpečná zařízenícs5letníVolitelnýzkano
DFAaDigitální forenzní analýza (v angličtině)en5letníVolitelnýzkano
DJADynamické jazykycs5letníVolitelnýzkano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5letníVolitelnýzá,zkano
FVSFunkční verifikace číslicových systémůcs5letníVolitelnýzkne
FYOFyzikální optikacs5letníVolitelnýzkano
GISGeografické informační systémycs5letníVolitelnýzá,zkano
WAPInternetové aplikacecs5letníVolitelnýzá,zkano
LOGLogikacs5letníVolitelnýzá,zkano
MPRManagement projektůcs5letníVolitelnýzá,zkano
MEKManažerská ekonomikacs5letníVolitelnýzá,zkano
HMRMarketingcs5letníVolitelnýzá,zkano
MMATMaticový a tenzorový početcs5letníVolitelnýzá,zkano
MULMultimédiacs5letníVolitelnýzkano
OPMOptimalizacecs4letníVolitelnýzá,zkano
PESPetriho sítěcs5letníVolitelnýzkano
PISPokročilé informační systémycs5letníVolitelnýzá,zkano
PMAProjektový manažercs5letníVolitelnýklano
C2PSítě s vícevrstevným přepínáním (SWITCH)cs5letníVolitelnýklne
SLOaSložitost (v angličtině)en5letníVolitelnýzkano
C1PSměrování v rozsáhlých sítích (ROUTE)cs5letníVolitelnýklano
SSPStochastické procesycs4letníVolitelnýzá,zkano
STMStrategický managementcs5letníVolitelnýzá,zkano
FSYSSystémová biologie cs5letníVolitelnýzá,zkano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5letníVolitelnýzá,zkano
UXIaUživatelská zkušenost a návrh rozhraní a služeb (v angličtině)en5letníVolitelnýklano
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)en5letníVolitelnýklano
VYFVýpočetní fotografiecs5letníVolitelnýklano
VGEVýpočetní geometriecs5letníVolitelnýzkano
VNVVysoce náročné výpočtycs5letníVolitelnýzkano
MMZSVyšší metody zpracování signálůcs6letníVolitelnýzá,zkano
ZPXZahraniční odborná praxeen5letníVolitelnýano
ZPOZpracování obrazucs5letníVolitelnýzkano