Životopis

Vzdělání a akademická kvalifikace

• 2010, Ph.D., Fakulta strojního inženýrství VUT v Brně, obor Fyzikální a materiálové inženýrství (téma: Mikroskopie časově proměnných biologických objektů)
• 2006, Ing., Fakulta strojního inženýrství VUT v Brně, obor Přesná mechanika a optika

Přehled zaměstnání

• 2008-01-01 - 2008-12-31

  Technický pracovník , FSI, VUT v Brně
  úvazek 0,5

• 2009-01-01 - 2010-01-31

  Asistent, FSI, VUT v Brně
  úvazek 0,5

• 2010-02-01 - 2011-02-28

  Odborný asistent, FSI, VUT v Brně
  úvazek 1,0

• 2011-07-01 - 2015-11-10

  Postdoktorský pracovník, Neurovaskulární zobrazování, UCSD, Kalifornie
  úvazek 1,0

• 2015-11-11 - ...

  Vědecký pracovník, CEITEC, VUT v Brně
  úvazek 0,2

• 2016-11-11 - ...

  Odborný asistent, FSI, VUT v Brně
  úvazek 0,2

Pedagogická činnost

2006-2010 kurzy Fyzika I a Fyzika II - teoretická cvičení

2009-2010 přednáška Základy fluorescenční mikroskopie

2010-2012 vedení diplomových a bakalářských projektů (Aneta Jebáčková, Lukáš Hladík, Jan Bartoníček)

12/2013 Dynamické zobrazování v neurovědách (IBRO), dvoutýdenní mezinárodní letní škola: přednáška a experimentální demonstrace

Vědeckovýzkumná činnost

• Kivilcim Kilic, Hana Uhlirova, Peifang Tian, Mohammad Abbas Yaseen, Jonghwan Lee, Sergei A. Vinogradov,  David A. Boas, Sava Sakadzic, Anna Devor. Tools for high resolution in vivo imaging of cellular and molecular mechanisms in cortical spreading depression and spreading depolarization. In: Neurobiological Basis of Migraine. Wiley. V tisku.

• Uhlirova H, Kilic K, Tian P, Sakadzic S, Gagnon L, Thunemann M, Desjardins M, Saisan PA, Nizar K, Yaseen MA, Hagler DJ Jr, Vandenberghe M, Djurovic S, Andreassen OA, Silva GA, Masliah E, Kleinfeld D, Vinogradov S, Buxton RB, Einevoll GT, Boas DA, Dale AM, Devor A. The roadmap for estimation of cell-type-specific neuronal activity from non-invasive measurements. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2016 Oct 5;371(1705).

• H. Uhlirova , K. Kilic , P. Tian , M. Thunemann , M. Desjardins , P. Saisan , S. Sakadzic , T. Ness , C. Mateo, Q. Cheng , K. Weldy , F. Razoux , M. Vanderberghe , J. Cremonesi, K. Nizar , V. Sridhar , T. Steed , M. Abashin , S. Fainman , E.r Masliah , S. Djurovic , O. Andreassen , G. Silva , D. Boas , D. Kleinfeld , R. Buxton , G. T. Einevoll , A. Dale. Cell type specificity of neurovascular coupling in cerebral cortex. eLIFE 5 (2016), p. e14315.

• K. Nizar, H. Uhlirova, P. Tian, P. A. Saisan, Q. Cheng, L. Reznichenko, K. L. Weldy, T. C. Steed, V. B. Sridhar, C. L. MacDonald, J. Cui, S. L. Gratiy, S. Sakadzic, D. A. Boas, T. I. Beka, G. T. Einevoll, J. Chen, E. Masliah, A. M. Dale, G. A. Silva, A. Devor. J Neurosci 33, pp. 8411-22 (2013), ISSN: 0270-6474.

• H. Janeckova, P. Vesely, R. Chmelik, Proving tumour cells by acute nutritional/energy deprivation as a survival threat: a task for microscopy. Anticancer Research 29, pp. 2339-2346 (2009), ISSN: 0250-7005.

• P. Kolman, H. Janeckova, R. Chmelik, Digital holographic microscopy at the IPE, BUT. Fine mechanics and optics (Czech) 7-8, 206-208 (2009), ISSN: 0447-6441.

• H. Janeckova, P. Kolman, P. Vesely, R. Chmelik, Digital holographic microscope with low spatial and temporal coherence of illumination. In: Optical and digital image processing, Proc of SPIE, 7000, c. 700002E, pp. 1 - 8, 2008 (ISSN: 0277-786X, ISBN: 9780819471987).

Akademické stáže v zahraničí

• 2005, Queen Mary University of London, Laboratoř výzkumu tvrdé tkáně, Centre of Oral Growth and Development (prof. Alan Boyde)
• 2005 Cancer Research UK, Laboratoř světelné mikroskopie (Ing. Daniel Zicha, Ph.D.)

Klíčová slova

mikroskopie, dvoufotonová mikroskopie, fluorescenční mikroskopie, zobrazovaní mozku, zobrazování kalcia, fluorescenční lifetime, neurovaskulání komunikace, NADH, elektrofyziologie, uncaging, holografická mikroskopie, biologické aplikace mikroskopie

Projekty

• 2011 - 2015 Neuronové, gliové a BOLD fMRI signály: Od BOLD k 2-fotonové mikroskopii (R01 NS057198-01, řešitel: Anna Devor, PhD)

• 2011 - 2015 Prostoro-časové zobrazování mozku: Mikroskopická a systémová úroveň (R01EB000790-06,  řešitel: Anders Dale, PhD)

• 2006 Obrazová rekonstrukce trojrozměrných objektů metodami holografické konfokální mikroskopie (GAČR 202/04/410, řešitel: doc. RNDr. Radim Chmelík,Ph.D.).

• 2007 Mikroskopie časově proměnných bioloických objektů, project Fakulty strojního inženýrství (řešitel Ing. Hana Janečková) – vítězný project v kategorii aplikace.

• od 2008 Funkční  hybridní nanosystémy polovodičů a kovů s organickými materiály, program Nanotechnologie pro společnost (GAAV, řešitel RNDr. Bohuslav Rezek, Ph.D.).

• 2008–2010Využití digitálního holografického mikroskopu pro výzkum dynamiky živé buňky a dovršení vývoje nového multifunkčního mikroskopu (GAČR 202/08/0590, řešitel: doc. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D.).