Publication detail

Software for patients and brain regions selection suitable for analysis of connectivity in fMRI

SLAVÍČEK, T. JAN, J.

Original Title

Software pro výběr pacientů a oblastí mozku vhodných k analýze konektivity z fMRI dat

Czech Title

Software pro výběr pacientů a oblastí mozku vhodných k analýze konektivity z fMRI dat

English Title

Software for patients and brain regions selection suitable for analysis of connectivity in fMRI

Type

conference paper

Language

cs

Original Abstract

Tento článek popisuje nástroj pro pomoc neurovědcům optimalizovat parametry analýzy konektivity v fMRI datech. Jedná se hlavně o výběr pacientů a oblastí mozku. Představený nástroj umožňuje uživateli vidět skupinové aktivační mapy a mapy jednotlivců zároveň. Uživatelé dále mohou vyhodnocovat podobnosti aktivačních map mezi subjekty, sledovat variabilitu ve skupinových datech a mapu minimální statistiky. Pokročilé uživatelsky přívětivé prostředí je navrženo pro maximalizaci produktivity, vše je rychle dostupné. Uživatel může vyexportovat seznam subjektů a oblastí a pokračovat tak v analýze konektivity s relevantními daty.

Czech abstract

Tento článek popisuje nástroj pro pomoc neurovědcům optimalizovat parametry analýzy konektivity v fMRI datech. Jedná se hlavně o výběr pacientů a oblastí mozku. Představený nástroj umožňuje uživateli vidět skupinové aktivační mapy a mapy jednotlivců zároveň. Uživatelé dále mohou vyhodnocovat podobnosti aktivačních map mezi subjekty, sledovat variabilitu ve skupinových datech a mapu minimální statistiky. Pokročilé uživatelsky přívětivé prostředí je navrženo pro maximalizaci produktivity, vše je rychle dostupné. Uživatel může vyexportovat seznam subjektů a oblastí a pokračovat tak v analýze konektivity s relevantními daty.

English abstract

This paper describes a MATLAB tool proposed to help neuroscientists optimizing parameters of connectivity analysis in fMRI datasets, such as subjects and regions selection. Presented exploratory tool allows users to view both group and single-subject activation map at the same time, so they can evaluate similarity of activations between subjects. Alternatively users can view variability of group data or minimal statistics map. The advanced GUI is designed to maximize productivity by offering all necessary functions by one click. Users can export list of suitable subjects and/or regions to complete the connectivity analysis.

Keywords

fMRI, connectivity, group analysis, general linear model, MATLAB

RIV year

2012

Released

26.04.2012

Publisher

BUT

Location

Brno

ISBN

978-80-214-4462-1

Book

Proceedings of the 18th conference EEICT 2012

Pages from

88

Pages to

90

Pages count

3

BibTex


@inproceedings{BUT91765,
  author="Tomáš {Slavíček} and Jiří {Jan}",
  title="Software pro výběr pacientů a oblastí mozku vhodných k analýze konektivity z fMRI dat",
  annote="Tento článek popisuje nástroj pro pomoc neurovědcům optimalizovat parametry analýzy konektivity v fMRI datech. Jedná se hlavně o výběr pacientů a oblastí mozku. Představený nástroj umožňuje uživateli vidět skupinové aktivační mapy a mapy jednotlivců zároveň. Uživatelé dále mohou vyhodnocovat podobnosti aktivačních map mezi subjekty, sledovat variabilitu ve skupinových datech a mapu minimální statistiky. Pokročilé uživatelsky přívětivé prostředí je navrženo pro maximalizaci produktivity, vše je rychle dostupné. Uživatel může vyexportovat seznam subjektů a oblastí a pokračovat tak v analýze konektivity s relevantními daty.",
  address="BUT",
  booktitle="Proceedings of the 18th conference EEICT 2012",
  chapter="91765",
  howpublished="print",
  institution="BUT",
  year="2012",
  month="april",
  pages="88--90",
  publisher="BUT",
  type="conference paper"
}