Product detail

Genotyper - software pro genotypizaci

SEDLÁŘ, K. ŠKUTKOVÁ, H. KOŠČOVÁ, P. VADJÁK, Š. PROVAZNÍK, I.

Product type

software

Abstract

Program slouží na především další analýzu dat zpracovaných softwarem Amplicon. Funguje však i s libovolnými sekvencemi uloženými ve FASTA formátu. Analýza spočívá v genotypizaci organismu na základě vstupních sekvencí oproti zvolené referenční databázi. K tomu využívá algoritmus BLAST. Výstupem je tabulka nejpodobnějších sekvencí ke každé sekvenci dotazu, je možný i výstup ve formátu proměnné MATLAB či, excel tabulky.

Keywords

genotypizace, amplikon

Create date

16. 9. 2014

Location

Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12 61600 Brno

Possibilities of use

Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)

Licence fee

Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

www

http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty