Project detail

Nano-elektro-bio-nástroje pro biochemické a molekulárně-biologické studie eukaryotických buněk (NanoBioTECell)

Duration: 01.01.2011 — 31.12.2015

Funding resources

Czech Science Foundation - Standardní projekty

- whole funder (2011-11-01 - not assigned)

Mark

GAP102/11/1068

Default language

Czech

People responsible

Provazník Valentine, prof. Ing., Ph.D. - principal person responsible

Units

Department of Biomedical Engineering
- (2011-11-01 - not assigned)

Results

ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; ADAM, V.; TRNKOVÁ, L.; BABULA, P.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. A New Approach how to Define the Coefficient of Electroactivity of Adenine and Its Twelve Derivatives Using Flow Injection Analysis with Amperometric Detection. ELECTROANALYSIS, 2011, vol. 23, no. 7, p. 1556-1567. ISSN: 1040-0397.
Detail

KUBICOVÁ, V.; MAJZLÍK, P.; PROVAZNÍK, I.; VALLA, M.; KIZEK, R. Processing of electrochemical signals for determination of metallothionein concentration. In Sborník XI. pracovního sektání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: MENDELU, 2011. p. 70-73. ISBN: 978-80-7375-514-0.
Detail

SEDLÁČEK, J.; BIDMANOVÁ, Š.; PROKOP, Z.; DAMBORSKÝ, J.; HUBÁLEK, J. Analyzer for Fluorescent Biosensing Application. In ISSE 2011 - Conference Proceedings. Košice: Technical University of Košice, 2011. p. 600-603. ISBN: 978-1-4577-2111-3.
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I. Motives in Nucleotide Densities of Birds Mitochondrial Gene COX1. In ACM Digital Library: Proceedings of 4th International Symposium on Applied Sciences in Biomedical and Communication Technologies. Barcelona: 2011. p. 1-5. ISBN: 978-1-4503-0913-4.
Detail

SEDLÁČEK, J.; BIDMANOVÁ, Š.; PROKOP, Z.; MIKEL, B.; HUBÁLEK, J. Instrument for fluorescent biosensor. In XI. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Mendlova univerzita v Brně, 2011. p. 243-245. ISBN: 978-80-7375-514-0.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Influence of sample variance on the phylogenetic reconstruction of protein sequences. In ACM digital library: Proceedings of 4th International Symposium on Applied Sciences in Biomedical and Communication Technologies. 2011. p. 1-5. ISBN: 978-1-4503-0913-4.
Detail

BUŠINOVÁ, P.; CHOMOUCKÁ, J.; PRÁŠEK, J.; HRDÝ, R.; DRBOHLAVOVÁ, J.; SEDLÁČEK, P.; HUBÁLEK, J. Polymer-coated iron oxide magnetic nanoparticles – preparation and characterization. In NANOCON 2011 - sborník příspěvků. Tanger, 2011. p. 1-6. ISBN: 978-80-87294-27-7.
Detail

CHOMOUCKÁ, J.; DRBOHLAVOVÁ, J.; MASAŘÍK, M.; VACULOVIČOVÁ, M.; HÚSKA, D.; PRÁŠEK, J.; HORNA, A.; TRNKOVÁ, L.; PROVAZNÍK, I.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Nanotechnologies for society: new designs and applications of nanosensors and nanobiosensors in medicine and environmental analysis. International Journal of Nanotechnology, 2012, vol. 9, no. 8/9, p. 746-783. ISSN: 1475-7435.
Detail

CHOMOUCKÁ, J.; VACULOVIČOVÁ, M.; DRBOHLAVOVÁ, J.; JANŮ, L.; ADAM, V.; PRÁŠEK, J.; KIZEK, R.; HUBÁLEK, J. Synthesis and modification of quantum dots for medical applications. In NANOCON 2011 - sborník příspěvků. TANGER spol. s r.o., 2011. p. 1-6. ISBN: 978-80-87294-27-7.
Detail

DRBOHLAVOVÁ, J.; CHOMOUCKÁ, J.; ADAM, V.; VACULOVIČOVÁ, M.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Nanocarriers for anticancer drugs - New trends in nanomedicine. CURRENT DRUG METABOLISM, 2013, vol. 14, no. 5, p. 547-564. ISSN: 1389-2002.
Detail

KIZEK, R.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J. Electrochemictry in space. In XI. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. Brno: MU a MENDELU, 2011. p. 12-16. ISBN: 978-80-7375-514-0.
Detail

KIZEK, R.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J. Electrochemical data from space. In XI. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. Brno: MU a MENDELU, 2011. p. 56-58. ISBN: 978-80-7375-514-0.
Detail

ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Robotic module Eurydice. In XI. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. Brno: MU a MENDELU, 2011. p. 62-64. ISBN: 978-80-7375-514-0.
Detail

HYNEK, D.; KŘÍŽKOVÁ, S.; KREJČOVÁ, L.; GUMULEC, J.; VACULOVIČOVÁ, M.; CERNEI, N.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; TRNKOVÁ, L.; STIBOROVÁ, M.; ECKSCHLAGER, T.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Femtogram electroanalytical detection of prostatic specific antigen by Brdicka reaction. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 7, no. 3, p. 1749-1766. ISSN: 1452-3981.
Detail

ŠOBROVÁ, P.; RYVOLOVÁ, M.; HÚSKA, D.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; ADAM, V.; KIZEK, R. Voltammetry of Adiponectin and its Interactions with Collagen on a Carbon Paste Electrode at Femtogram Level. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 7, no. 1, p. 1-12. ISSN: 1452-3981.
Detail

ABO KHAYAL, L.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Improvement of Electrophoresis Performance by Spectral Analysis. AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2012, vol. 11, no. 51, p. 11329-11332. ISSN: 1684-5315.
Detail

BALOGH, J.; SOCHOR, J.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Computer analysis of growth curves of staphylococcus aureus. In Sborník příspěvků: XII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrotechniků. Brno: LITERA Brno, 2012. p. 14-16. ISBN: 978-80-7375-618-5.
Detail

KŘÍŽKOVÁ, S.; VACULOVIČOVÁ, M.; HYNEK, D.; ECKSCHLAGER, T.; HODEK, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; KIZEK, R. Immunoextraction of zinc proteins from human plasma using chicken yolk antibodies immobilized onto paramagnetic particles and their electrophoretic analysis. Electrophoresis, 2012, vol. 33, no. 12, p. 1824-1832. ISSN: 0173-0835.
Detail

ŠOBROVÁ, P.; RYVOLOVÁ, M.; HYNEK, D.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Electrochemical behaviour of Native and Denatured B-Sheet Breaker Prion Protein. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 7, no. 2, p. 928-942. ISSN: 1452-3981.
Detail

MASAŘÍK, M.; GUMULEC, J.; HLAVNA, M.; SZTALMACHOVÁ, M.; BABULA, P.; RAUDENSKÁ, M.; PÁVKOVÁ GOLDBERGOVÁ, M.; CERNEI, N.; SOCHOR, J.; ZÍTKA, O.; RUTTKAY-NEDECKÝ, B.; KŘÍŽKOVÁ, S.; ADAM, V.; KIZEK, R. Monitoring of the prostate tumour cells redox state and real-time proliferation by novel biophysical techniques and fluorescent staining. Integrative Biology, 2012, vol. 6, no. 4, p. 672-684. ISSN: 1757-9694.
Detail

KUBICOVÁ, V.; PROVAZNÍK, I. Determination of relationship among mycoplasmas based on RGB and non-RGB spectrogram analysis. In PROCEEDINGS of the 10th International Conference on INFORMATION COMMUNICATION TECHNOLOGIES IN HEALTH. Řecko: 2012. p. 299-305. ISBN: 978-618-5009-04-5.
Detail

KUBICOVÁ, V.; PROVAZNÍK, I. Similarity Of Cyanobacteria Based On The Comparison Of Whole Protein Coding Information. In Sborník příspěvků: XII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrotechniků. Brno: LITERA Brno, 2012. p. 116-118. ISBN: 978-80-7375-618-5.
Detail

BABULA, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; TRNKOVÁ, L.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Mammalian metallothioneins: properties and functions. METALLOMICS, 2012, vol. 4, no. 1, p. 739-750. ISSN: 1756-5901.
Detail

ŠMERKOVÁ, K.; DOSTÁLOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Isolation of Xis Gen Fragment of lambda Phage from Agarose Gel Using Magnetic Particles for Subsequent Enzymatic DNA Sequencing. CHROMATOGRAPHIA, 2012, vol. 2012, no. 10, p. 1-6. ISSN: 0009-5893.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Preprocessing and classification of electroforetic gel image using dynamic time warping. In Sborník - XII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Mendelova univerzita v Brně, 2012. p. 280-282. ISBN: 978-80-7375-618-5.
Detail

PROVAZNÍK, I.; KUBICOVÁ, V.; ŠKUTKOVÁ, H.; NEDVĚD, J.; TKACZ, E.; BABULA, P.; KIZEK, R. Detection of Short Exons in DNA Sequences Using Complex Wavelet Transform of Structural Features. In Proceedings of IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics 2012. 2012. p. 1-4. ISBN: 978-1-4673-0491-7.
Detail

HLAVNA, M.; RAUDENSKÁ, M.; HUDCOVÁ, K.; GUMULEC, J.; SZTALMACHOVÁ, M.; TANHÄUSEROVÁ, V.; BABULA, P.; ADAM, V.; ECKSCHLAGER, T.; KIZEK, R.; MASAŘÍK, M. MicroRNAs and zinc metabolism-related gene expression in prostate cancer cell lines treated with zinc(II) ions. INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY, 2012, vol. 41, no. 6, p. 2237-2244. ISSN: 1019-6439.
Detail

VACULOVIČOVÁ, M.; PEKÁRKOVÁ, J.; DRBOHLAVOVÁ, J.; KOPEL, P.; BABULA, P.; HYNEK, D.; ADAM, V.; ECKSCHLAGER, T.; HUBÁLEK, J.; STIBOROVÁ, M.; KAISER, J.; KIZEK, R. Modern Micro and Nanoparticle-Based Imaging Techniques. SENSORS, 2012, vol. 12, no. 11, p. 14792-14820. ISSN: 1424-8220.
Detail

ZÍTKA, O.; SKALIČKOVÁ, S.; GUMULEC, J.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; TRNKOVÁ, L.; KIZEK, R. Redox status expressed as GSH:GSSG ratio as a marker for oxidative stress in paediatric tumour patients. Oncology Letters, 2012, vol. 4, no. 4, p. 1247-1253. ISSN: 1792-1082.
Detail

MAJZLÍKOVÁ, P.; PRÁŠEK, J.; CHOMOUCKÁ, J.; HUBÁLEK, J. Cu2O Nanoparticles Based Working Electrode for Direct Glucose Detection. Bratislava: Slovak Chemical Society, 2012. p. 76-76.
Detail

SZTALMACHOVÁ, M.; GUMULEC, J.; CERNEI, N.; HLAVNA, M.; ZÍTKA, O.; BABULA, P.; ADAM, V.; KIZEK, R.; MASAŘÍK, M. Prostatický specifický antigen, metalothionein a caveolin-1 jako markery vzniku a rozvoje karcinomu prostaty. Chemické listy, 2012, roč. 106, č. 11, s. 1075-1080. ISSN: 0009-2770.
Detail

HRDÝ, R.; KYNCLOVÁ, H.; DRBOHLAVOVÁ, J.; CHOMOUCKÁ, J.; PRÁŠEK, J.; SOLOVEI, D.; BUŠINOVÁ, P.; PEKÁREK, J.; HUBÁLEK, J. Characterization of Ordered Metal Gold Nanowires Fabrication Property Via Hexagoan Ordered Nanoporous Alumina. In NANOCON 2012 - Conference Proceedings. Ostrava: TANGER Ltd., 2012. p. 1-6. ISBN: 978-80-87294-27-7.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; STIBOROVÁ, M.; ECKSCHLAGER, T.; TRNKOVÁ, L.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R.; ADAM, V. Structure, Polymorphisms and Electrochemistry of Mammalian Metallothioneins – A Review. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 2012, no. 7, p. 12415-12431. ISSN: 1452-3981.
Detail

ŠOBROVÁ, P.; VYSLOUŽILOVÁ, L.; ŠTĚPÁNKOVÁ, O.; VACULOVIČOVÁ, M.; ANÝZ, J.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Tissue Specific Electrochemical Fingerprinting. PLOS ONE, 2012, vol. 7, no. 11, p. 1-12. ISSN: 1932-6203.
Detail

ABO KHAYAL, L.; PROVAZNÍK, I.; TKACZ, E. Differential Analysis of Neurodegenerative Aging-Related Mitochondrial Genes of Long-Lived Naked Mole-Rat. International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics, 2013, vol. 3, no. 2, p. 75-79. ISSN: 2010-3638.
Detail

KREJČOVÁ, L.; HÚSKA, D.; HYNEK, D.; KOPEL, P.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; TRNKOVÁ, L.; KIZEK, R. Using of Paramagnetic Microparticles and Quantum Dots for Isolation and Electrochemical Detection of Influenza Viruses Specific Nucleic Acids. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 8, no. 1, p. 689-702. ISSN: 1452-3981.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; KŘÍŽKOVÁ, S.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Preprocessing and Classification of Electrophoresis Gel Images Using Dynamic Time Warping. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 2013(8), no. 2, p. 1609-1620. ISSN: 1452-3981.
Detail

PEKAŘÍK, V.; GUMULEC, J.; MASAŘÍK, M.; KIZEK, R.; ADAM, V. Prostate cancer, miRNAs, metallothioneins and resistance to cytostatic drugs. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY, 2013, vol. 20, no. 4, p. 534-544. ISSN: 0929-8673.
Detail

RONZHINA, M.; ČMIEL, V.; JANOUŠEK, O.; KOLÁŘOVÁ, J.; NOVÁKOVÁ, M.; BABULA, P.; PROVAZNÍK, I. Application of the optical method in experimental cardiology: action potential and intracellular calcium concentration measurement. Physiological Research, 2013, vol. 62, no. 2, p. 125-137. ISSN: 0862-8408.
Detail

KREJČOVÁ, L.; HYNEK, D.; KOPEL, P.; MERLOS RODRIGO, M.; TMEJOVÁ, K.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Quantum Dots for Electrochemical Labelling of Neuramidinase Genes of H5N1, H1N1 and H3N2 Influenza. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 8, no. 4, p. 4457-4471. ISSN: 1452-3981.
Detail

CERNEI, N.; ZÍTKA, O.; SKALIČKOVÁ, S.; GUMULEC, J.; SZTALMACHOVÁ, M.; MERLOS RODRIGO, M.; SOCHOR, J.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; TRNKOVÁ, L.; KRUSEOVÁ, J.; ECKSCHLAGER, T.; KIZEK, R. Effect of sarcosine on antioxidant parameters and metallothionein content in the PC-3 prostate cancer cell line. ONCOLOGY REPORTS, 2013, vol. 29, no. 6, p. 2459-2466. ISSN: 1021-335X.
Detail

VACULOVIČOVÁ, M.; ŠMERKOVÁ, K.; SEDLÁČEK, J.; VYSLOUŽIL, J.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R.; ADAM, V. Integrated chip electrophoresis and magnetic particle isolation used for detection of hepatitis B virus oligonucleotides. Electrophoresis, 2013, vol. 34, no. 11, p. 1548-1554. ISSN: 0173-0835.
Detail

STANISAVLJEVIC, M.; JANŮ, L.; ŠMERKOVÁ, K.; KŘÍŽKOVÁ, S.; PIZÚROVÁ, N.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Study of Streptavidin-Modified Quantum Dots by Capillary Electrophoresis. CHROMATOGRAPHIA, 2013, vol. 76, no. 7-8, p. 335-343. ISSN: 0009-5893.
Detail

KREJČOVÁ, L.; HYNEK, D.; KOPEL, P.; MERLOS RODRIGO, M.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; BABULA, P.; TRNKOVÁ, L.; KIZEK, R. Development of a magnetic electrochemical bar code array for point mutation detection in the H5N1 neuraminidase gene. VIRUSES-BASEL, 2013, vol. 5, no. 7, p. 1719-1739. ISSN: 1999-4915.
Detail

ZÍTKA, O.; SKALIČKOVÁ, S.; MERLOS RODRIGO, M.; KREJČOVÁ, L.; KOPEL, P.; ADAM, V.; KIZEK, R. Sequences of pandemic-causing viruses isolated and detected by paramagnetic particles coupled with microfluidic system and electrochemical detector. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 8, no. 12, p. 12628-12642. ISSN: 1452-3981.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; BABULA, P.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Classification of genomic signals using dynamic time warping. BMC BIOINFORMATICS, 2013, vol. 14, no. 10, p. 1-7. ISSN: 1471-2105.
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I. Classification of species to higher taxa based on analysis of DNA barcodes - a bird example. In The 10th International Workshop on Computational Systems Biology. Tampere: 2013. p. 75-79. ISBN: 978-952-15-3092-0.
Detail

BABULA, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. From Na+/K+-ATPase and Cardiac Glycosides to Cytotoxicity and Cancer Treatment. Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry, 2013, vol. 13, no. 7, p. 1069-1087. ISSN: 1871-5206.
Detail

KUBICOVÁ, V.; NEDVĚD, J.; PROVAZNÍK, I. Detection of Repeated DNA Sequences Using Digital Signal Processing Tools. In Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013, Zborníkkonferencie. 1. Košice: Technická univerzita v Košiciach, 2013. p. 129-132. ISBN: 978-80-8086-208-4.
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I. Identifikace organismů pomocí nukleotidové denzitní analýzy mitochondriální DNA. In Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013. 2013. s. 1-3. ISBN: 978-80-8086-208-4.
Detail

KYNCLOVÁ, H.; PŘIBYL, J.; HRDÝ, R.; DRBOHLAVOVÁ, J.; PRÁŠEK, J.; HUBÁLEK, J. Comparison of gold nanostructured electrode and flat gold electrode on doxorubicin measurements. In Conference Proceedings 5th International Conference NANOCON 2013. Ostrava: Tanger, Ltd., 2013. p. 215-219. ISBN: 978-80-87294-47-5.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování. In Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013. 2013. s. 1-5. ISBN: 978-80-8086-208-4.
Detail

ZÍTKA, O.; KOMÍNKOVÁ, M.; SKALIČKOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; KIZEK, R. Single Amino Acid Change in Metallothionein Metal-Binding Cluster Influences Interaction with Cisplatin. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 8, no. 2, p. 2625-2634. ISSN: 1452-3981.
Detail

ŠMERKOVÁ, K.; DOSTÁLOVÁ, S.; VACULOVIČOVÁ, M.; KYNICKÝ, J.; TRNKOVÁ, L.; KRÁLÍK, M.; ADAM, V.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Investigation of interaction between magnetic silica particles andlambda phage DNA fragment. JOURNAL OF PHARMACEUTICAL AND BIOMEDICAL ANALYSIS, 2013, vol. 86, no. 1, p. 65-72. ISSN: 0731-7085.
Detail

MÁRIK, M.; SVATOŠ, V.; PEKÁREK, J.; CHOMOUCKÁ, J.; HUBÁLEK, J. Novel nanoelectrode system for extracellular potential measurement of cells. In Conference Proceedings 5th International Conference NANOCON 2013. 1. Ostrava: Tanger, Ltd., 2013. p. 297-301. ISBN: 978-80-87294-47-5.
Detail

HRDÝ, R.; HUBÁLEK, J.; VRBOVÁ, E.; DRBOHLAVOVÁ, J.; KYNCLOVÁ, H.; SVATOŠ, V. Glutathione Modified Gold Nanoelectrodes and Electrochemical Characterization. In Sborník příspěvků XIII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 2013. p. 64-65. ISBN: 978-80-7375-757-1.
Detail

SVATOŠ, V.; DRBOHLAVOVÁ, J.; MÁRIK, M.; PEKÁREK, J.; CHOMOUCKÁ, J.; HUBÁLEK, J. Optimizing Thermal Evaporation Process Compared to Magnetron Sputtering for Fabrication of Titania Quantum Dots. In Conference Proceedings 5th International Conference NANOCON 2013. 1. Ostrava: Tanger, Ltd., 2013. p. 192-196. ISBN: 978-80-87294-47-5.
Detail

JANŮ, L.; STANISAVLJEVIC, M.; KŘÍŽKOVÁ, S.; ŠOBROVÁ, P.; VACULOVIČOVÁ, M.; KIZEK, R.; ADAM, V. Electrophoretic study of peptide-mediated quantum dot-human immunoglobulin bioconjugation. Electrophoresis, 2013, vol. 34, no. 18, p. 2725-2732. ISSN: 0173-0835.
Detail

DRBOHLAVOVÁ, J.; MOZALEV, A.; SVATOŠ, V.; HRDÝ, R.; KALINA, L.; HUBÁLEK, J. SELF-ORDERED GOLD QUANTUM DOTS ARRAY FOR IN VITRO BIOSENSING. In Conference Proceedings 5th International Conference Nanocon 2013. 1. Brno: Tanger, Ltd., 2013. p. 1-6. ISBN: 978-80-87294-44-4.
Detail

MOHAN, R.; DRBOHLAVOVÁ, J.; HUBÁLEK, J. Water-dispersible TiO2 nanoparticles via a biphasic solvothermal reaction method. Nanoscale Research Letters, 2013, vol. 2013, no. 8, p. 1-4. ISSN: 1931-7573.
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D. Analýza nukleotidových denzit jako metoda pro identifikaci organismů. In Nové směry v biomedicínském inženýrství. Brno: 2013. s. 8-13. ISBN: 978-80-214-4814-8.
Detail

MOHAN, R.; DRBOHLAVOVÁ, J.; HUBÁLEK, J. LUMINESCENCE ENHANCEMENT IN CARBON DOTS BY H2O2. In Conference Proceedings 5th International Conference Nanocon 2013. 1. Brno: Tanger, Ltd., 2013. p. 1-6. ISBN: 978-80-87294-44-4.
Detail

KOLEK, J.; SEDLÁŘ, K.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P. Draft Genome Sequence of Clostridium pasteurianum NRRL B-598, a Potential Butanol or Hydrogen Producer. Genome Announcements, 2014, vol. 2, no. 2, p. 1-2. ISSN: 2169-8287.
Detail

NEJDL, L.; RUTTKAY-NEDECKÝ, B.; KUDR, J.; KŘÍŽKOVÁ, S.; ŠMERKOVÁ, K.; DOSTÁLOVÁ, S.; VACULOVIČOVÁ, M.; KOPEL, P.; ZEHNÁLEK, J.; TRNKOVÁ, L.; BABULA, P.; ADAM, V.; KIZEK, R. DNA interaction with zinc(II) ions. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, 2014, vol. 64, no. 3, p. 281-287. ISSN: 0141-8130.
Detail

NEJDL, L.; MERLOS RODRIGO, M.; KUDR, J.; RUTTKAY-NEDECKÝ, B.; NOVOTNÁ, M.; KOPEL, P.; ZÍTKA, O.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R.; ADAM, V. Liposomal nanotransporter for targeted binding based on nucleic acid anchor system. Electrophoresis, 2014, vol. 35, no. 2-3, p. 393-404. ISSN: 0173-0835.
Detail

FOJTŮ, M.; GUMULEC, J.; BALVAN, J.; RAUDENSKÁ, M.; SZTALMACHOVÁ, M.; POLANSKÁ, H.; ŠMERKOVÁ, K.; ADAM, V.; KIZEK, R.; MASAŘÍK, M. Utilization of paramagnetic microparticles for automated isolation of free circulating mRNA as a new tool in prostate cancer diagnostics. Electrophoresis, 2014, vol. 35, no. 2-3, p. 306-315. ISSN: 0173-0835.
Detail

SEDLÁŘ, K.; PROVAZNÍK, I. LTRFIND: A Novel Algorithm for Human de novo LTR Retrotransposons Identification. In Proceedings of the 20th Conference STUDENT EEICT 2014. Brno: LITERA, 2014. p. 242-246. ISBN: 978-80-214-4924-4.
Detail

ROY, S.; PROVAZNÍK, I. In-silico characterization of human metallothionein (MT-1E) and its role in prevention and therapy of bladder cancer with dietary agents. In 2014 IEEE 27th International Symposium on Computer-Based Medical Systems. New York: IEEE, 2014. p. 469-470. ISBN: 978-1-4799-4435-4.
Detail

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Prokaryotic DNA Signal Downsampling for Fast Whole Genome Comparison. Advances in Intelligent Systems and Computing, 2014, vol. 283, no. 6, p. 373-383. ISSN: 2194-5357.
Detail

KUBICOVÁ, V.; PROVAZNÍK, I. Relationship of bacteria using comparison of whole genome sequences in frequency domain. Advances in Intelligent Systems and Computing, 2014, vol. 283, no. 6, p. 397-408. ISSN: 2194-5357.
Detail

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Identification and Characterization of Sol Operon in Clostridium Pasteurianum NRRL B-598 Genome. In 2. mezinárodní chemicko-technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. 1. Mikulov: 2014. p. 1-5. ISBN: 978-80-86238-61-6.
Detail

KOLEK, J.; SEDLÁŘ, K.; BRANSKÁ, B.; ŠKUTKOVÁ, H.; LINHOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; MELZOCH, K.; PATÁKOVÁ, P. Clostridium pasteurianum NRRL B-598 Phenotype Matching Genotype?. Clostridium XIII book of abstracts. Shangai, China: 2014. p. 69-69.
Detail

ROY, S.; KUMAR, A.; PROVAZNÍK, I. Virtual screening, ADMET profiling, molecular docking and dynamics approaches to search for potent selective natural molecule based inhibitors against metallothionein-III to study Alzheimer's disease. In Proceedings IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). Belfast, United Kingdom: IEEE, 2014. p. 352-356. ISBN: 978-1-4799-5669-2.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; PROVAZNÍK, I. Bioinformatic study of genetic variability of superoxide dismutase isoforms. In 2. mezinárodní chemicko-technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. Mikulov: 2014. p. 1-6. ISBN: 978-80-86238-61-6.
Detail

KYNCLOVÁ, H.; DRBOHLAVOVÁ, J.; SVATOŠ, V.; HRDÝ, R.; PRÁŠEK, J.; HUBÁLEK, J. Thermal stabiliy of gold nanosteructured electrodes and influence of annealing on electrochemical impedance measurements. In Nanocon 2014 Conference proceedings. Ostrava: Tanger, Ltd., 2014. p. 158-163. ISBN: 978-80-87294-53-6.
Detail

MÁRIK, M.; SVATOŠ, V.; HUBÁLEK, J. High resolution technics for fabrication of special nanoelectrodes. XIV. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: MUNI Press, 2014. p. 203-205. ISBN: 978-80-210-6842-1.
Detail

KREMPLOVÁ, M.; FIALOVÁ, D.; NEJDL, L.; HYNEK, D.; TRNKOVÁ, L.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R.; ADAM, V. Influence of Magnetic Microparticles Isolation on Adenine Homonucleotides Structure. Materials, 2014, vol. 7, no. 3, p. 1455-1472. ISSN: 1996-1944.
Detail

KREJČOVÁ, L.; HYNEK, D.; ADAM, V.; KIZEK, R.; HUBÁLEK, J. Electrochemical Sensors and Biosensors for Influenza Detection. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 7, no. 11, p. 10779-10801. ISSN: 1452-3981.
Detail

KUBICOVÁ, V.; PROVAZNÍK, I. Use of whole genome DNA spectrograms in bacterial classification. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2015, vol. 69, no. February 2016, p. 298-307. ISSN: 0010-4825.
Detail

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Set of rules for genomic signal downsampling. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2015, vol. 64, no. p1, p. 1-7. ISSN: 0010-4825.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; SEDLÁŘ, K.; PROVAZNÍK, I. Progressive alignment of genomic signals by multiple dynamic time warping. Journal of Theoretical Biology, 2015, vol. 2015, no. 385, p. 20-30. ISSN: 0022-5193.
Detail

SEDLÁŘ, K.; KOLEK, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; BRANSKÁ, B.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P. Complete genome sequence of Clostridium pasteurianum NRRL B-598, a non-type strain producing butanol. Journal of Biotechnology, 2015, vol. 214, no. 1, p. 113-114. ISSN: 0168-1656.
Detail

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍDEŇSKÁ, P.; RYCHLÍK, I.; PROVAZNÍK, I. Bipartite Graphs for Metagenomic Data Analysis and Visualization. In Proceedings 2015 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2015). 1. Washington D.C.: IEEE, 2015. p. 1123-1128. ISBN: 978-1-4673-6798-1.
Detail

KOLEK, J.; SEDLÁŘ, K.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P. Dam and Dcm methylations prevent gene transfer into Clostridium pasteurianum NRRL B-598: development of methods for electrotransformation, conjugation, and sonoporation. BIOTECHNOL BIOFUELS, 2016, vol. 9, no. 1, p. 1-14. ISSN: 1754-6834.
Detail

SHARMA, V.; HYNEK, D.; TRNKOVÁ, L.; HEMZAL, D.; MÁRIK, M.; KIZEK, R.; HUBÁLEK, J. Electrochemical determination of adenine using a glassy carbon electrode modified with graphene oxide and polyaniline. Microchimica Acta, 2016, vol. 161, no. 457, p. 1-8. ISSN: 0026-3672.
Detail

VLACHOVÁ, J.; TMEJOVÁ, K.; KOPEL, P.; KORABÍK, M.; ZÍTKA, J.; HYNEK, D.; KYNICKÝ, J.; ADAM, V.; KIZEK, R. A 3D Microfluidic Chip for Electrochemical Detection of Hydrolysed Nucleic Bases by a Modified Glassy Carbon Electrode. SENSORS, 2015, vol. 15, no. 2, p. 2438-2452. ISSN: 1424-8220.
Detail

SKALIČKOVÁ, S.; KOPEL, P.; ZÍTKA, O.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; KIZEK, R. Nanoparticles modified glassy carbon electrode coupled with microfluidic for nucleic acids analysis contained the repetitions of adenine. Chemické listy, 2015, vol. 109, no. 4, p. 298-304. ISSN: 1213-7103.
Detail

ŠMERKOVÁ, K.; HUDCOVÁ, K.; VLAHOVÁ, V.; VACULOVIČOVÁ, M.; PEKAŘÍK, V.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; KÍZEK, R. Label-free and amplification-free miR-124 detection in human cells. INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY, 2015, vol. 46, no. 2, p. 871-877. ISSN: 1019-6439.
Detail

RUTTKAY-NEDECKÝ, B.; SKALIČKOVÁ, S.; KREMPLOVÁ, M.; NEJDL, L.; KUDR, J.; HYNEK, D.; NOVOTNÁ, M.; LABUDA, J.; ADAM, V.; KIZEK, R. Formation of G-quadruplex and its utilizing for an automated spectrometric detection of cisplatin. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2015, vol. 10, no. 5, p. 3973-3987. ISSN: 1452-3981.
Detail

NĚMCOVÁ, A.; JANOUŠEK, O.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Testing of features for fatigue detection in EOG. BIO-MEDICAL MATERIALS AND ENGINEERING, 2017, vol. 28, no. 4, p. 379-392. ISSN: 0959-2989.
Detail

RUTTKAY-NEDECKÝ, B.; KUDR, J.; NEJDL, L.; MAŠKOVÁ, D.; KIZEK, R.; ADAM, V. G-Quadruplexes as Sensing Probes. MOLECULES, 2013, vol. 18, no. 12, p. 14760-14779. ISSN: 1420-3049.
Detail

ŠMERKOVÁ, K.; STANISAVLJEVIC, M.; BLAŽKOVÁ, I.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; KIZEK, R. MICRO RNA-124 DETERMINATION EMPLOYING MAGNETIC PARTICLES AND QUANTUM DOTS. In CECE 2014. 2014. p. 396-399. ISBN: 978-80-904959-2-0.
Detail

GUMULEC, J.; SZTALMACHOVÁ, M.; RAUDENSKÁ, M.; MASAŘÍK, M.; KIZEK, R. Revealing the role of zinc(II) in prostate cancer pathogenesis. In MENDELNET 2012. 2012. p. 934-941. ISBN: 978-80-7375-836-3.
Detail

KOMÍNKOVÁ, M.; ZÍTKA, O.; MERLOS RODRIGO, M.; ZEHNÁLEK, J.; HAVEL, L.; ADAM, V.; KIZEK, R. DEVELOPMENT OF METHODIC OF TOTAL GLUTATHIONE AMOUNT DETERMINATION. In MENDELNET 2012. 2012. p. 1218-1224. ISBN: 978-80-7375-836-3.
Detail

VLACHOVÁ, J.; HYNEK, D.; KOUDELKOVÁ, Z.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; KIZEK, R. ELECTROCHEMICAL DETECTION OF MIR-124 ISOLATED BY MAGNETIC PARTICLES. In CECE 2015. 2015. p. 217-220. ISBN: 978-80-904959-3-7.
Detail

NEJDL, L.; SOCHOR, J.; JÍLKOVÁ, E.; ŠMERKOVÁ, K.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; KIZEK, R. STUDY COVALENT INTERACTIONS FRAGMENT. DNA WITH CISPLATIN. In MENDELNET 2012. 2012. p. 1244-1249. ISBN: 978-80-7375-836-3.
Detail

SKALIČKOVÁ, S.; KOPEL, P.; ZÍTKA, O.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; KIZEK, R. Nanoparticles-Modified Glassy Carbon Electrode in Microflow Arrangement for Analysis of Nucleic Acids Containing Repeated Adenine Sequences. Chemické listy, 2015, vol. 109, no. 4, p. 298-304. ISSN: 0009-2770.
Detail

VLACHOVÁ, J.; ZÍTKA, J.; KOUDELKOVÁ, Z.; HYNEK, D.; ADAM, V.; KIZEK, R.; VACULOVIČOVÁ, M. PDMS FLUIDIC CHIP FOR MIRNA DETECTION. In CECE 2015. 2015. p. 213-216. ISBN: 978-80-904959-3-7.
Detail

ČMIEL, V.; KUBICOVÁ, V.; PROVAZNÍK, I.: STIM-GEN; Generátor obdélníkových napěťových pulzů pro stimulaci buněk vnějším elektrickým polem. Ústav biomedicínského inženýrství FEKT VUT v Brně. URL: http://www.dbme.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (funkční vzorek)
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I.: NUDANSI; Nástroj pro analýzu nukleotidových denzitních vektorů pro identifikaci organismů. Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12, 61200 Brno. URL: http://www.dbme.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I.: PhyloGenSig; PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů. Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12 61600 Brno. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail

NEDVĚD, J.; POLÁŠKOVÁ, L.; PROVAZNÍK, I.: S2DESA; S2DESA. Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12, 616 00 Brno. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail

MÁRIK, M.; SVATOŠ, V.; HUBÁLEK, J.: platinove nanohroty; Platinové nanohroty pro elektrická měření buňek Platinové nanohroty pro elektrická měření buňek. Technická 10, N0.66. URL: http://www.umel.feec.vutbr.cz/LabSensNano/products.aspx?id=89. (funkční vzorek)
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I.: R_NucDen; Balíček funkcí v jazyce R pro výpočet nukleotidových denzitních vektorů a jejich komparativní analýzu. Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12, 61200 Brno. URL: http://www.dbme.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail

ČMIEL, V.: VIABILITY; Programové vybavení pro hodnocení viability kardiomyocytů na základě analýzy tvaru, doby života fluorescence a intenzity fluorescence. UBMI. URL: http://www.dbme.feec.vutbr.cz. (software)
Detail

VADJÁK, Š.; SEDLÁŘ, K.; KOŠČOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I.: BLAST Sequence Analyzer; BLAST Sequence Analyzer. Ústav biomedicínksého inženýrství, FEKT VUT v Brně Technická 12 616 00 Brno. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail

VADJÁK, Š.; ŠKUTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K.; KOŠČOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I.: PhylogenTree Analyzer; PhylogenTree Analyzer. Ústav biomedicínksého inženýrství, FEKT VUT v Brně Technická 12 616 00 Brno. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOŠČOVÁ, P.; VADJÁK, Š.; PROVAZNÍK, I.: Genotyper; Genotyper - software pro genotypizaci. Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12 61600 Brno. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (software)
Detail