Ing.

Helena Škutková

Ph.D.

FEEC, UBMI – assistant professor

+420 54114 6684
skutkova@feec.vutbr.cz

Send BUT message

Ing. Helena Škutková, Ph.D.

Publications

  • 2019

    BARTOŇ, V.; ŠKUTKOVÁ, H. Watershed Segmentation for Peak Picking of High-Resolution Mass Spectrometry Data. In Proceedings of IEEE Student Branch Conference Mikulov2019. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2019. p. 23-25. ISBN: 978-80-214-5781-2.
    Detail

    JUGAS, R.; VÍTEK, M.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; ŠKUTKOVÁ, H. Signal processing based CNV detection in bacterial genomes. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019. Lecture Notes in Computer Science. Granada, Spain: Springer Verlag, 2019. p. 93-102. ISBN: 978-3-030-17937-3. ISSN: 0302-9743.
    Detail | WWW

    NYKRÝNOVÁ, M.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Entropy-Based Detection of Genetic Markers for Bacteria Genotyping. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019. Lecture Notes in Computer Science. 2019. p. 177-188. ISBN: 978-3-030-17934-2. ISSN: 0302-9743.
    Detail

    BARTOŇ, V.; NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Clustering of Klebsiella Strains Based on Variability in Sequencing Data. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019. Lecture Notes in Computer Science. 2019. p. 189-199. ISBN: 978-3-030-17934-2. ISSN: 0302-9743.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; SEDLÁŘ, K.; JUGAS, R.; VÍTEK, M. A degeneration-reducing criterion for optimal digital mapping of genetic codes. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, vol. 17, no. 1, p. 406-414. ISSN: 2001-0370.
    Detail | WWW

    NYKRÝNOVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Method for improving the consensus sequence from NGS data based on reads classification. In Proceedings of IEEE Student Branch Conference Mikulov 2019. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2019. p. 6-9. ISBN: 978-80-214-5781-2.
    Detail | WWW

    MADĚRÁNKOVÁ, D.; JUGAS, R.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Rapid bacterial species delineation based on parameters derived from genome numerical representations. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, vol. 17, no. 1, p. 118-126. ISSN: 2001-0370.
    Detail | WWW

    ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; BEZDÍČEK, M.; BRHELOVÁ, E.; LENGEROVÁ, M. Advanced DNA fingerprint genotyping based on a model developed from real chip electrophoresis data. Journal of Advanced Research, 2019, vol. 18, no. 18, p. 9-18. ISSN: 2090-1232.
    Detail | WWW

  • 2018

    JUGAS, R.; VÍTEK, M.; SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H. Cross-Correlation Based Detection of Contigs Overlaps. In MIPRO 2018 proceedings. Croatia, Rijeka, Kružna 8/II: MIPRO Croatian Society, 2018. p. 177-188. ISBN: 978-953-233-096-0.
    Detail

    NYKRÝNOVÁ, M.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Bioinformatic Tools for Genotyping of Klebsiella pneumoniae Isolates. In Information Technology in Biomedicine. 2018. p. 419-428. ISBN: 978-3-319-91210-3.
    Detail

  • 2017

    JUGAS, R.; SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M. Overlap detection for a genome assembly based on genomic signal processing. In 2017 IEEE 30th International Symposium on Computer-Based Medical Systems. Proceedings of the ... IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems. USA: IEEE Computer Society, 2017. p. 301-305. ISBN: 978-1-5386-1710-6. ISSN: 2372-9198.
    Detail | WWW

    MADĚRÁNKOVÁ, D.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; ŠKUTKOVÁ, H. The identification of replication origin in bacterial genomes by cumulated phase signal. In 2017 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB). IEEE, 2017. p. 1-5. ISBN: 978-1-4673-8988-4.
    Detail | WWW

  • 2016

    SEDLÁŘ, K.; VÍDEŇSKÁ, P.; ŠKUTKOVÁ, H.; RYCHLÍK, I.; PROVAZNÍK, I. Bipartite Graphs for Visualization Analysis of Microbiome Data. EVOLUTIONARY BIOINFORMATICS, 2016, vol. 12, no. S1, p. 17-23. ISSN: 1176-9343.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

  • 2015

    SEDLÁŘ, K.; KOLEK, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; BRANSKÁ, B.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P. Complete genome sequence of Clostridium pasteurianum NRRL B-598, a non-type strain producing butanol. Journal of Biotechnology, 2015, vol. 214, no. 1, p. 113-114. ISSN: 0168-1656.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Bacterial Genome Assembly in Biotechnology: Clostridium Pasteurianum NRRL B- 598 Genome. 3. mezinárodní chemicko- technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. Mikulov: Academic and Medical Conference Agency, 2015. p. 1 (1 s.). ISBN: 978-80-86238-73- 9.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Set of rules for genomic signal downsampling. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2015, vol. 64, no. p1, p. 1-7. ISSN: 0010-4825.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

    ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; SEDLÁŘ, K.; PROVAZNÍK, I. Progressive alignment of genomic signals by multiple dynamic time warping. Journal of Theoretical Biology, 2015, vol. 2015, no. 385, p. 20-30. ISSN: 0022-5193.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍDEŇSKÁ, P.; RYCHLÍK, I.; PROVAZNÍK, I. Bipartite Graphs for Metagenomic Data Analysis and Visualization. In Proceedings 2015 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2015). 1. Washington D.C.: IEEE, 2015. p. 1123-1128. ISBN: 978-1-4673-6798- 1.
    Detail

  • 2014

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Prokaryotic DNA Signal Downsampling for Fast Whole Genome Comparison. Advances in Intelligent Systems and Computing, 2014, vol. 283, no. 6, p. 373-383. ISSN: 2194-5357.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Bioinformatics for biotechnology research: data mining of Clostridium pasteurianum genome. BioTech 2014 and 6th Czech- Swiss Symposium with Exhibition Book of Abstracts. 1. Praha: Institute of Chemical Technology Prague, 2014. p. 64-64. ISBN: 978-80-7080-887- 0.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Identification and Characterization of Sol Operon in Clostridium Pasteurianum NRRL B- 598 Genome. In 2. mezinárodní chemicko-technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. 1. Mikulov: 2014. p. 1-5. ISBN: 978-80-86238-61- 6.
    Detail

    KOLEK, J.; SEDLÁŘ, K.; BRANSKÁ, B.; ŠKUTKOVÁ, H.; LINHOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; MELZOCH, K.; PATÁKOVÁ, P. Clostridium pasteurianum NRRL B-598 Phenotype Matching Genotype?. Clostridium XIII book of abstracts. Shangai, China: 2014. p. 69-69.
    Detail | WWW

    ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; PROVAZNÍK, I. Bioinformatic study of genetic variability of superoxide dismutase isoforms. In 2. mezinárodní chemicko-technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. Mikulov: 2014. p. 1-6. ISBN: 978-80-86238-61- 6.
    Detail

    SOCHOR, J.; JUŘÍKOVÁ, T.; POHANKA, M.; ŠKUTKOVÁ, H.; BAROŇ, M.; TOMÁŠKOVÁ, L.; BALLA, Š.; KLEJDUS, B.; POKLUDA, R.; MLČEK, J.; TROJÁKOVÁ, Z.; ŠALOUN, J. Evaluation of Antioxidant Activity, Polyphenolic Compounds, Amino Acids and Mineral Elements of Representative Genotypes of Lonicera edulis. MOLECULES, 2014, vol. 19, no. 5, p. 6505-6523. ISSN: 1420-3049.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

  • 2013

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I. Compressed DNA signal representation for classification of long sequences. In XIII pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. Brno: LITERA BRNO, 2013. p. 135-136. ISBN: 978-80-7375-757- 1.
    Detail

    ZÍTKA, O.; KOMÍNKOVÁ, M.; SKALIČKOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; KIZEK, R. Single Amino Acid Change in Metallothionein Metal-Binding Cluster Influences Interaction with Cisplatin. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 8, no. 2, p. 2625-2634. ISSN: 1452-3981.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování. In Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013. 2013. p. 1-5. ISBN: 978-80-8086-208- 4.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; BABULA, P.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Classification of genomic signals using dynamic time warping. BMC BIOINFORMATICS, 2013, vol. 14, no. 10, p. 1-7. ISSN: 1471- 2105.
    Detail | WWW

    ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; KŘÍŽKOVÁ, S.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Preprocessing and Classification of Electrophoresis Gel Images Using Dynamic Time Warping. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, vol. 2013(8), no. 2, p. 1609-1620. ISSN: 1452- 3981.
    Detail

  • 2012

    BABULA, P.; VODIČKA, O.; ADAM, V.; KUMMEROVÁ, M.; HAVEL, L.; HOŠEK, J.; PROVAZNÍK, I.; ŠKUTKOVÁ, H.; BEKLOVÁ, M.; KIZEK, R. Effect of fluoranthene on plant cell model: Tobacco BY- 2 suspension culture. ENVIRONMENTAL AND EXPERIMENTAL BOTANY, 2012, vol. 2012, no. 78, p. 117-126. ISSN: 0098- 8472.
    Detail

    VACULOVIČOVÁ, M.; HYNEK, D.; ŠKUTKOVÁ, H.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Structural changes in metallothionein isoforms revealed by capillary electrophoresis and Brdicka reaction. Electrophoresis, 2012, vol. 33, no. 2, p. 270-279. ISSN: 0173-0835.
    Detail

    SOCHOR, J.; SALAŠ, P.; ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; PROVAZNÍK, I.; ADAM, V.; KIZEK, R. Environmental monitoring of soil conditioner effects on photosynthetic parameters of Acer campestre L. AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2012, vol. 11, no. 58, p. 4007-4021. ISSN: 1684- 5315.
    Detail

    BABULA, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; TRNKOVÁ, L.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Mammalian metallothioneins: properties and functions. METALLOMICS, 2012, vol. 4, no. 1, p. 739-750. ISSN: 1756-5901.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; STIBOROVÁ, M.; ECKSCHLAGER, T.; TRNKOVÁ, L.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R.; ADAM, V. Structure, Polymorphisms and Electrochemistry of Mammalian Metallothioneins – A Review. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 2012, no. 7, p. 12415-12431. ISSN: 1452- 3981.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Preprocessing and classification of electroforetic gel image using dynamic time warping. In Sborník - XII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Mendelova univerzita v Brně, 2012. p. 280-282. ISBN: 978-80-7375-618- 5.
    Detail

    ZÍTKA, O.; KOMÍNKOVÁ, M.; SKALIČKOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; ADAM, V.; TRNKOVÁ, L.; KIZEK, R. Hydrodynamic Voltammograms Profiling of Metallothionein Fragment. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, vol. 7, no. 11, p. 10544-10561. ISSN: 1452- 3981.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H. Predikce sekundární struktury proteinů pomocí neuronové sítě. In Sborní z konference: Student EEICT 2012. Brno: VUT Brno, 2012. p. 1-3. ISBN: 978-80-214-4462- 1.
    Detail

    PROVAZNÍK, I.; KUBICOVÁ, V.; ŠKUTKOVÁ, H.; NEDVĚD, J.; TKACZ, E.; BABULA, P.; KIZEK, R. Detection of Short Exons in DNA Sequences Using Complex Wavelet Transform of Structural Features. In Proceedings of IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics 2012. 2012. p. 1-4. ISBN: 978-1-4673-0491- 7.
    Detail

    ŠMERKOVÁ, K.; DOSTÁLOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Isolation of Xis Gen Fragment of lambda Phage from Agarose Gel Using Magnetic Particles for Subsequent Enzymatic DNA Sequencing. CHROMATOGRAPHIA, 2012, vol. 2012, no. 10, p. 1-6. ISSN: 0009-5893.
    Detail

  • 2011

    ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; MAJZLÍK, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Analytické nástroje pro sledování komplexů platiny. In XXXV. Brněnské onkologické dny. Brno: Masarykův onkologický ústav, 2011. p. 334-335. ISBN: 978-80-86793-17- 7.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H. Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction. In Sborník soutěže Student EEICT 2011. Brno: VUT v Brně, 2011. p. 130-132. ISBN: 978-80-214-4271- 9.
    Detail

    ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; KRYŠTOFOVÁ, O.; ŠOBROVÁ, P.; ADAM, V.; ZEHNÁLEK, J.; BEKLOVÁ, M.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Rapid and Ultrasensitive Method for Determination of Phytochelatin2 using High Performance Liquid Chromatography with Electrochemical Detection. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2011, vol. 2011 (6), no. 5, p. 1367-1381. ISSN: 1452-3981.
    Detail

    ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; ADAM, V.; TRNKOVÁ, L.; BABULA, P.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. A New Approach how to Define the Coefficient of Electroactivity of Adenine and Its Twelve Derivatives Using Flow Injection Analysis with Amperometric Detection. ELECTROANALYSIS, 2011, vol. 23, no. 7, p. 1556-1567. ISSN: 1040-0397.
    Detail

    SEDLÁŘ, K.; SMERKOVÁ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; SOCHOR, J.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. DPPH aqueous antioxidant assay solution. In XI. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: 2011. p. 250-254. ISBN: 978-80-7375-514- 0.
    Detail

    MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I.; ŠKUTKOVÁ, H. Výukové aplikace pro zpracování genomických dat v bioinformatických předmětech. In Trendy v biomedicínském inženýrství 2011. Ostrava: 2011. p. 56-58. ISBN: 978-80-248-2475- 8.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I. Výuka molekulární fylogenetiky v bioinformatických předmětech. In Sborník konference Trendy v Biomedicínském inženýrství 2011. VŠB - Technická univerzita Ostrava, 2011. p. 52-55. ISBN: 978-80-248-2475- 8.
    Detail

    TRNKOVÁ, L.; HÚSKA, D.; ŠKUTKOVÁ, H.; BEKLOVÁ, M.; HUBÁLEK, J.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Paramagnetic antibody- modified microparticles coupled with voltammetry as a tool for isolation and detection of metallothionen as a bioindicator of metal pollution. JOURNAL OF ENVIRONMENTAL MONITORING, 2011, vol. 2011, no. 13, p. 2763-2769. ISSN: 1464- 0325.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Influence of sample variance on the phylogenetic reconstruction of protein sequences. In ACM digital library: Proceedings of 4th International Symposium on Applied Sciences in Biomedical and Communication Technologies. 2011. p. 1-5. ISBN: 978-1-4503-0913- 4.
    Detail

    SOCHOR, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; ZÍTKA, O.; CERNEI, N.; ROP, O.; KRŠKA, B.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Mathematical evaluation of the amino acid and polyphenol content and antioxidant activities of fruits from different apricot cultivars. MOLECULES, 2011, vol. 16, no. 9, p. 7428-7457. ISSN: 1420-3049.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

  • 2010

    ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Similarity analysis of primary and secondary structures of metallothioneins. In The 10th IEEE International Conference on Information Technology and Applications in Biomedicine: Emerging Technologies for Patient Specific Healthcare. Corfu: IEEE, 2010. p. 1-4. ISBN: 978-1-4244-6560- 6.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Mutual Similarity of Aminoacid Sequences in Family of Metallothioneins. In Sborník příspěvků. MUNI Brno, 2010. p. 211-212. ISBN: 978-80-7375-396- 2.
    Detail

    ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Fylogenetická stromová struktura vybraných sub- rodin metallothioneinů. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Muni Press, 2010. p. 77-78. ISBN: 978-80-210-5164- 5.
    Detail

    SOCHOR, J.; ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; PAVLÍK, D.; BABULA, P.; KRŠKA, B.; HORNA, A.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Content of phenolic compounds and antioxidant capacity in fruits of selected genotypes of apricot with resistance against Plum pox virus. MOLECULES, 2010, vol. 2010, no. 15, p. 6285-6305. ISSN: 1420-3049.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

    ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Relationships Of Bacterial Metallothioneins Analyses: Phylogenetic Tree Construction Method. In Analysis of Biomedical Signals and Images. Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno: VUT v Brně, 2010. p. 1-6. ISBN: 978-80-214-4106- 4. ISSN: 1211- 412X.
    Detail

    ROP, O.; SOCHOR, J.; JUŘÍKOVÁ, T.; ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; MLČEK, J.; SALAŠ, P.; KRŠKA, B.; BABULA, P.; ADAM, V.; KRAMÁŘOVÁ, D.; BEKLOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Effect of five different stages of ripening on chemical compounds in medlar (Mespilus germanica L.). MOLECULES, 2010, vol. 16, no. 1, p. 74-91. ISSN: 1420-3049.
    Detail | WWW | Full text in the Digital Library

*) Publications are generated once a 24 hours.